Un nouveau modèle (C-GEM, Volta et al., 2014) a récemment été mis au point pour répondre à la nécessité de généraliser les modèles estuariens. Il s'agit d'un modèle biogéochimique 1-D longitudinal avec un modèle hydrodynamique simplifié néanmoins capable de simuler la propagation et dispersion de l’énergie de marée le long du système et donc le fonctionnement de ces zones de mélange en se basant sur une représentation simplifiée de leur géométrie ne nécessitant qu’un nombre limité de paramètres : la longueur, la profondeur, la longueur de convergence de l'estuaire, ainsi que la largeur du chenal aux limites maritimes et terrestres. Le module biogéochimique de C-GEM inclut une description explicite de tous les éléments nutritifs (nitrates, ammonium, phosphates et silice dissoute), de l'oxygène dissous, du phytoplancton (diatomées et les non-diatomées). C-GEM s'appuie sur un paramétrage générique dérivé d'une vaste collection d'études de modélisation réalisées sur des hydrosystèmes tempérés (Volta et al., 2016a). Le partage de nombreuses variables d’état entre les modèles rivière RIVERSTRAHLER et estuaire C-GEM a permis leur couplage sur la Seine (Laruelle et al., 2019).
